Biyolojide Veri Madenciliği
Fen - Edebiyat FakültesiBiyoloji
- Kodu
- BYLB442
- Yarıyılı
- 2026-2027 Bahar Yarıyılı
- Teorik
- 0
- Uyg.-Lab
- 3-0
- Kredi
- 1.5
- AKTS
- 4
- Dersin türü
- Seçmeli
- Düzeyi
- Lisans
- Dili
- Türkçe
- Kategorisi
- Uzmanlık / alan dersleri
- Ön koşul (tavsiye)
- .
- Dersi veren
- Prof. Dr. ELİFE ZERRİN BAĞCI
Dersin amacı
Biyolojide veri madenciliği alanındaki uygulamaları bilgisayar ortamında gerçekleştirmek
Öğrenme çıktıları
- ÖÇ-1R ile programlama yapabilir
- ÖÇ-2Veri Biliminin temellerini bilir
- ÖÇ-3Biyolojik verilerin analizi
Dersin içeriği
R ile veri madenciliği
Haftalık konular
| Hafta | Konu | Ön hazırlık / yöntem |
|---|---|---|
| 1 | Veri Bilimine Giris | |
| 2 | R programlama - I | |
| 3 | R programlama - II | |
| 4 | R programlama - III | |
| 5 | R programlama - IV | |
| 6 | R programlama - V | |
| 7 | R programlama - VI | |
| 8 | R programlama - VII | |
| 9 | R programlama - VIII | |
| 10 | Proje çalışması | |
| 11 | Proje çalışması | |
| 12 | Proje çalışması | |
| 13 | Proje sunumları | |
| 14 | Proje sunumları | |
| 15 | Final | |
| 16 | Final |
Kaynaklar ve materyaller
- Ders notu
- R for Data Science, Wickham ve Grolelund, 2017
- Diğer kaynaklar
- https://tr.r4ds.hadley.nz/
Değerlendirme
- Ödev 1 %20
- Arasınav 1 %30
- Dönem Sonu Sınavı %50
Program çıktıları ile ilişkisi
- PÇ-1Bağımsız olarak öğrenme ve sonra öğrendiği bilgi ve becerilerini sözlü ya da yazılı olarak başkalarına aktarma becerisi gösterir
- PÇ-2Bilimsel yöntemin süreçlerini uygulayabilme, bunun için gerekli olan temel laboratuvar tekniklerini ve araç gereçlerini kullanabilme becerisi geliştirir ve lisansüstü eğitime hazır olur
- PÇ-3Biyolojideki ilgi alanını belirler, seçeceği derslerle bu alanda sağlam bir bilgi temeli oluşturur.
- PÇ-4Biyolojik çeşitliliği bilerek ulusal biyolojik kaynakları tanımlar, bunları koruma ve çevreye saygılı olma bilinci kazanır
- PÇ-5Biyolojinin fizik, kimya ve matematik temellere dayandığını bilir, biyolojik verileri yorumlamada istatistiksel yöntemleri uygulama becerisi gösterir.
- PÇ-6Biyolojinin toplumsal işlevini bilen, mesleki sorumluluk bilincinde ve bilimsel etik değerlere bağlı birey olur.
- PÇ-7Gelişen bilgi ve teknolojiye ulaşıp onu takip edebilecek, yabancı meslektaşlarıyla iletişim kurabilecek, temel makaleleri okuyup tartışabilecek, ulaştığı bilginin kalitesini değerlendirebilecek düzeyde İngilizceye sahip olur, ayrıca bilgisayar kullanım bilgi ve becerisi kazanır
- PÇ-8Molekül, gen, kromozom, hücre, organ ve organ sistemleri olmak üzere tüm biyolojik seviyelerde yapı, işlev ve süreç arasındaki ilişkileri analiz eder ve değerlendirir.
- PÇ-9Sağlık, gıda, tarım ve hayvancılık başta olmak üzere geniş bir yelpazede ülkemizin ekonomik gelişimine katkı sağlayacak düzeyde bilgi sahibi olur.
- PÇ-10Yaşamın kalıtsal temelini, genetik bilgi akışını ve bunların evrim teorisiyle ilişkisini ifade eder.
| ÖÇ-1 | ÖÇ-2 | ÖÇ-3 | |
|---|---|---|---|
| PÇ-1 | 2 | 2 | 2 |
| PÇ-2 | 0 | 0 | 0 |
| PÇ-3 | 1 | 1 | 1 |
| PÇ-4 | 0 | 0 | 0 |
| PÇ-5 | 0 | 0 | 0 |
| PÇ-6 | 0 | 0 | 0 |
| PÇ-7 | 3 | 3 | 3 |
| PÇ-8 | 0 | 0 | 0 |
| PÇ-9 | 0 | 0 | 0 |
| PÇ-10 | 0 | 0 | 0 |
AKTS iş yükü
| Etkinlik | Sayı | Süre | Toplam |
|---|---|---|---|
| Proje Hazırlama ve Sunma | 1 | 10 | 10 |
| Ders süresi(sınav haftası dahildir: toplam ders saati) | 16 | 3 | 48 |
| Sınıf dışı ders çalışma süresi(ön çalışma, pekiştirme) | 14 | 3 | 42 |
| Ara Sınav 1 | 1 | 8 | 8 |
| Yarıyıl Sınavı | 1 | 14 | 14 |
| Toplam iş yükü | 122 | ||
| Toplam iş yükü / 30 | 4 | ||
| Dersin AKTS kredisi | 4 | ||